More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0680 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 339 aa  662    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  48.56 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.74 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.26 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  50.43 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.88 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.15 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.36 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.82 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.35 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.35 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.92 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  43.19 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.94 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.11 
 
 		 352 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.98 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.55 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.12 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.52 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.49 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.67 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.77 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.84 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.82 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.99 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.65 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.71 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.24 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.07 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.11 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.44 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.44 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.44 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.64 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.91 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  40.92 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  39.71 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.85 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.14 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.94 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.09 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.02 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  40.4 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.82 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.05 
 
 		 352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.84 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.44 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.76 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.88 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.18 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.65 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.18 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.83 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.04 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.82 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.94 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.6 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.66 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.75 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 		 350 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.78 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.21 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.21 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.46 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.46 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.13 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>