More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4082 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  52.23 
 
 
330 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  51.89 
 
 
328 aa  311  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  51.55 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  51.2 
 
 
326 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  36.86 
 
 
343 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  34.25 
 
 
327 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  32.42 
 
 
333 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  34.71 
 
 
324 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  34.71 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.26 
 
 
325 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  33.45 
 
 
334 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  34.6 
 
 
327 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  33.79 
 
 
331 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  31.85 
 
 
328 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.95 
 
 
333 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.1 
 
 
324 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  35.71 
 
 
340 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.14 
 
 
330 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  33.22 
 
 
332 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  31.85 
 
 
321 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  30.8 
 
 
328 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  33.89 
 
 
339 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  33.89 
 
 
339 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  31.27 
 
 
330 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 
328 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  30.8 
 
 
322 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.79 
 
 
330 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  30.93 
 
 
322 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  36.3 
 
 
328 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  30.92 
 
 
325 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  34.88 
 
 
321 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  34.88 
 
 
321 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  32.75 
 
 
337 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  33.45 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  33.45 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  31.14 
 
 
323 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  29.31 
 
 
328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.69 
 
 
332 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  30 
 
 
326 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  30.93 
 
 
358 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6029  hypothetical protein  32.76 
 
 
316 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  34.03 
 
 
323 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  33.98 
 
 
321 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  32.65 
 
 
330 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  32.99 
 
 
324 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  33.59 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  32.2 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  32.55 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5962  hypothetical protein  31.4 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  29.35 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  33.9 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  32.3 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  30.63 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  29.9 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.56 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  33.92 
 
 
327 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 
330 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  33.9 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  30.38 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  33.08 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  30.48 
 
 
329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  29.49 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  28.52 
 
 
324 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  32.76 
 
 
330 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  28.67 
 
 
331 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  30.82 
 
 
323 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  33.11 
 
 
329 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0203  hypothetical protein  33.89 
 
 
355 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  31.83 
 
 
324 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  32.99 
 
 
327 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  31.85 
 
 
341 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  31.87 
 
 
322 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  32.06 
 
 
336 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  31.62 
 
 
321 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  29.41 
 
 
343 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  30.21 
 
 
323 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  29.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  31.85 
 
 
332 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  31.38 
 
 
327 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  31.53 
 
 
336 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  29.17 
 
 
324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  29.76 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  30.82 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  29.07 
 
 
333 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2013  hypothetical protein  33.82 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  32.08 
 
 
333 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  33.68 
 
 
342 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  30.24 
 
 
330 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  30.14 
 
 
335 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  29.76 
 
 
355 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  32.29 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  31.97 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>