163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0572 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
457 aa  902    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  40.94 
 
 
453 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  37.69 
 
 
469 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  36.24 
 
 
451 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  34.29 
 
 
443 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  35.16 
 
 
444 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  30.27 
 
 
453 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  33.65 
 
 
467 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  29.2 
 
 
450 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  30.39 
 
 
456 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.35 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 
449 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.57 
 
 
441 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  29.93 
 
 
434 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.27 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.93 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.06 
 
 
450 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.62 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.63 
 
 
481 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.78 
 
 
450 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.33 
 
 
460 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.35 
 
 
470 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 
463 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.23 
 
 
474 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  29.16 
 
 
454 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 
486 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.48 
 
 
470 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  32.7 
 
 
441 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.06 
 
 
442 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.86 
 
 
457 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.4 
 
 
454 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.74 
 
 
460 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  26.11 
 
 
456 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.82 
 
 
451 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.28 
 
 
463 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  23.69 
 
 
449 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 
469 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  27.42 
 
 
457 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 
445 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 
454 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  28.11 
 
 
462 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  28.89 
 
 
458 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.71 
 
 
503 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.62 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.71 
 
 
503 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 
446 aa  94  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.25 
 
 
503 aa  93.2  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  29.33 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  27.74 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  27.74 
 
 
491 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  27.74 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 
501 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  26.34 
 
 
482 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  28.84 
 
 
457 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  23.75 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  27.74 
 
 
461 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.61 
 
 
458 aa  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.27 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.76 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  26.78 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 
447 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  26.18 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.28 
 
 
468 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 
476 aa  90.1  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.32 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  28.97 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  24.05 
 
 
460 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.27 
 
 
487 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  29.04 
 
 
485 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  27.35 
 
 
456 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.66 
 
 
446 aa  87.8  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  27.45 
 
 
463 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  27.45 
 
 
464 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.2 
 
 
472 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  26.37 
 
 
462 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 
485 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  23.54 
 
 
453 aa  87  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.01 
 
 
458 aa  87  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  22.72 
 
 
449 aa  86.7  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  27.14 
 
 
500 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  26.38 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  30.17 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  23.58 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.38 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.13 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  27.29 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  26.07 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>