More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0299 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  85.37 
 
 
250 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  85.37 
 
 
250 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  84.65 
 
 
252 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  86.36 
 
 
247 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  73.44 
 
 
245 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  73.44 
 
 
249 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.45 
 
 
249 aa  316  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  61.9 
 
 
252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  64.32 
 
 
247 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61 
 
 
244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.89 
 
 
249 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.66 
 
 
242 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.75 
 
 
246 aa  299  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61 
 
 
246 aa  298  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 
284 aa  298  6e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58 
 
 
253 aa  298  6e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 
251 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  58.78 
 
 
261 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  60.42 
 
 
244 aa  295  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  61.48 
 
 
250 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.2 
 
 
245 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.8 
 
 
262 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.8 
 
 
262 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.22 
 
 
252 aa  294  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  58.06 
 
 
255 aa  293  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  59.84 
 
 
254 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  59.84 
 
 
254 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.37 
 
 
262 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  61.48 
 
 
248 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.83 
 
 
242 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
242 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  59.04 
 
 
260 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.68 
 
 
244 aa  292  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.79 
 
 
252 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  59.04 
 
 
266 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  60.5 
 
 
251 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.44 
 
 
255 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.24 
 
 
253 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  57.61 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 
252 aa  290  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 
252 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  57.61 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  61.32 
 
 
249 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.82 
 
 
253 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.61 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.61 
 
 
258 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.08 
 
 
244 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  61.67 
 
 
251 aa  290  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 
253 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.43 
 
 
243 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  59.18 
 
 
247 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  58.75 
 
 
254 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  60.42 
 
 
259 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.47 
 
 
257 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  56.4 
 
 
253 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.14 
 
 
253 aa  289  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  58 
 
 
251 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.34 
 
 
244 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.75 
 
 
247 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
253 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 
252 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 
252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  58.9 
 
 
266 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  58.78 
 
 
247 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.92 
 
 
253 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.61 
 
 
242 aa  287  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.69 
 
 
258 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  58.4 
 
 
267 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.69 
 
 
258 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.87 
 
 
256 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.61 
 
 
262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.24 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  59.22 
 
 
258 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.31 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.31 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  58.82 
 
 
273 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  60.92 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  58.7 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.26 
 
 
251 aa  285  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.69 
 
 
243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.22 
 
 
258 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  57.14 
 
 
247 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  59.58 
 
 
246 aa  285  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.4 
 
 
248 aa  285  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.74 
 
 
242 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.46 
 
 
240 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.8 
 
 
254 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.25 
 
 
273 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.09 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  57.44 
 
 
254 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.92 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
256 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.34 
 
 
242 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  58.4 
 
 
254 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
264 aa  284  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>