More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2568 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  40.99 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.71 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.89 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  39.04 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.04 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  31.15 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  35.6 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.8 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  38.64 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.31 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.77 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.73 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  50 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  41.18 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  35.21 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.51 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  36.26 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  39.38 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.42 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.88 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  31.01 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  46.72 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.95 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  31.01 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  32.26 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  30.35 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  36.59 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.43 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  38.71 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.94 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  37.42 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.3 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  36.87 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0261  putative competence protein F  31.76 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.33 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.2 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  36.25 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.8 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.51 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.63 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  36.14 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.63 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.51 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25.93 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  44.17 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  33.76 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  33.88 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  35.19 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.93 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  26.58 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  23.4 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  37.42 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  35 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  26.51 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>