More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2284 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.51 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.67 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.14 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.97 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.31 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.77 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.31 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.97 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  25.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 760 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  24.79 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.92 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  34.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  35.11 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  35.11 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 506 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  35.16 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.95 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.77 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  19.39 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  23.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.29 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  32.98 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.68 
 
 		 1370 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  32.98 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  32.98 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.11 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  32.98 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.81 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  32.98 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>