241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1575 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  100 
 
 
498 aa  1010    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  51 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  50.8 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  51.3 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  50.8 
 
 
496 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  50.7 
 
 
496 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  51.41 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  50.3 
 
 
496 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  51.41 
 
 
495 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  51.41 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  51.41 
 
 
495 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  53.23 
 
 
514 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  50.3 
 
 
496 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  51.41 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  50.8 
 
 
495 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  51.41 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  51.41 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  51.2 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  51 
 
 
495 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  49.7 
 
 
496 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  49.19 
 
 
496 aa  489  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  48.89 
 
 
493 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  53.37 
 
 
500 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  49.3 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  50.6 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  50.97 
 
 
503 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  39.11 
 
 
526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  41.88 
 
 
507 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  40.86 
 
 
500 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  40.28 
 
 
523 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  40.44 
 
 
523 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  41.88 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  41.88 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  41.06 
 
 
500 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  40.86 
 
 
500 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  41.33 
 
 
510 aa  322  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  40.49 
 
 
523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  40.08 
 
 
533 aa  320  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  41.67 
 
 
511 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  41.34 
 
 
508 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  40.64 
 
 
513 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  40.25 
 
 
508 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  38.59 
 
 
508 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  37.68 
 
 
508 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  39.44 
 
 
538 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  40.44 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  40 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.85 
 
 
517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  40.32 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  40.2 
 
 
513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  38.89 
 
 
508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  39.92 
 
 
507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  38.82 
 
 
513 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  39.01 
 
 
508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  38.38 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  38.67 
 
 
507 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  38.37 
 
 
515 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  38.28 
 
 
507 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  38.45 
 
 
519 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  38.65 
 
 
509 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  37.13 
 
 
509 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  38.35 
 
 
508 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  39.55 
 
 
507 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  39.75 
 
 
507 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  37.77 
 
 
508 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  39.18 
 
 
533 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  38.45 
 
 
510 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  38.17 
 
 
510 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  36.85 
 
 
516 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  38.7 
 
 
509 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.71 
 
 
505 aa  286  8e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  34.67 
 
 
548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  36.8 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  37.45 
 
 
514 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  37.63 
 
 
507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  38.97 
 
 
500 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  37.45 
 
 
514 aa  282  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  38.97 
 
 
500 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  33.69 
 
 
582 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  36.59 
 
 
509 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  36.18 
 
 
515 aa  276  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  35.14 
 
 
551 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  37.8 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  39.36 
 
 
512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  35.86 
 
 
546 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  37.02 
 
 
510 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  38.11 
 
 
507 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  36.53 
 
 
514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  38.87 
 
 
390 aa  256  5e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  33.75 
 
 
551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  33.39 
 
 
540 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  33.45 
 
 
554 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  33.52 
 
 
550 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  35.44 
 
 
388 aa  249  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  34.35 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  32.97 
 
 
552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  36.66 
 
 
385 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  35.1 
 
 
388 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  35.1 
 
 
388 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  35.1 
 
 
388 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>