148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10848 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  100 
 
 		 340 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05268  conserved hypothetical protein  37.59 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321428  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07935  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  37.18 
 
 		 138 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.36 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 221 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  34.09 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  35.62 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  24.89 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  31.87 
 
 		 95 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  32.67 
 
 		 874 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  25.87 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  35.62 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.25 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 90 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 104 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.58 
 
 		 97 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 90 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  36.99 
 
 		 524 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.99 
 
 		 119 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  32.95 
 
 		 90 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.18 
 
 		 96 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 99 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  27.59 
 
 		 245 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.07 
 
 		 101 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.77 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 		 102 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  35.56 
 
 		 88 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 90 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 89 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 90 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 82 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  35.56 
 
 		 1290 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  36 
 
 		 563 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 90 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  35.53 
 
 		 107 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  28.26 
 
 		 143 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 		 94 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 148 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 150 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 90 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 		 103 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 95 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  32.61 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  28.12 
 
 		 90 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 		 94 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 105 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  34.48 
 
 		 951 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  34.48 
 
 		 931 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  28.77 
 
 		 99 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 		 90 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 99 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  27.27 
 
 		 94 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 		 88 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 89 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  35.16 
 
 		 87 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  32.91 
 
 		 89 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  37.08 
 
 		 999 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 98 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 		 81 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 		 105 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 90 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 		 149 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 98 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 		 155 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 89 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 		 82 aa  47  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.22 
 
 		 98 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  28.44 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  28.38 
 
 		 112 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  28.38 
 
 		 107 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 90 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  36.99 
 
 		 84 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  28.77 
 
 		 104 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  31.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  30.26 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 		 85 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 109 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  29.73 
 
 		 81 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 122 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>