90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2451 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  100 
 
 		 618 aa  1246    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  58.41 
 
 		 611 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  100 
 
 		 618 aa  1246    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  100 
 
 		 618 aa  1246    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  51.94 
 
 		 611 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  51.7 
 
 		 611 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  50.5 
 
 		 599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  47.43 
 
 		 618 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  47.21 
 
 		 618 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  47.43 
 
 		 618 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  48.92 
 
 		 604 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  47.27 
 
 		 618 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  46.95 
 
 		 618 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  46.08 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  46.08 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  46.08 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  46.08 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  46.08 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  46.08 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  46.08 
 
 		 617 aa  555  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  45.92 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  45.59 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  45.6 
 
 		 615 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.92 
 
 		 606 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.01 
 
 		 695 aa  153  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.54 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  24.08 
 
 		 606 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.95 
 
 		 703 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.39 
 
 		 607 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.3 
 
 		 606 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.5 
 
 		 606 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.33 
 
 		 606 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  23.23 
 
 		 607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.9 
 
 		 607 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.1 
 
 		 607 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.18 
 
 		 614 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  22.51 
 
 		 614 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.44 
 
 		 611 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.11 
 
 		 604 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  22.02 
 
 		 608 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  20.29 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.37 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  20.19 
 
 		 696 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.41 
 
 		 712 aa  90.5  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  22.94 
 
 		 732 aa  87  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.35 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  19.58 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.44 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  21.02 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.39 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  20.58 
 
 		 682 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  20.22 
 
 		 797 aa  76.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  19.71 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  22.81 
 
 		 705 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.33 
 
 		 704 aa  67  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.58 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.07 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  25.93 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.7 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  20.96 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  20.44 
 
 		 826 aa  61.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  19.97 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  20.47 
 
 		 794 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.48 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  19.5 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.92 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  22.67 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  22.58 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  20.37 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  20.95 
 
 		 654 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.81 
 
 		 701 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.68 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.83 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22.37 
 
 		 750 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  22.43 
 
 		 1094 aa  54.7  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.26 
 
 		 748 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  20.22 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  30 
 
 		 740 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  29.92 
 
 		 675 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  19.05 
 
 		 741 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  21.76 
 
 		 660 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  20.11 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.22 
 
 		 609 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  21.76 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  27.72 
 
 		 711 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  26.67 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3491  hypothetical protein  23.57 
 
 		 432 aa  44.3  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350952  hitchhiker  0.000435394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>