More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2379 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  68.99 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  65.82 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  56.92 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  67.09 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  54.04 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  55.21 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  64.6 
 
 		 196 aa  227  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  55.56 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  53.97 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  52.85 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  57.56 
 
 		 197 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  63.29 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  56.25 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  53.5 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  51.55 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  51.55 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  44.67 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  44.9 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  53.95 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  45.13 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  45.51 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  48.37 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  45.51 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  48.37 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  47.8 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  49.67 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  50.96 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  49.02 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  48.72 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  43.08 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  42.7 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  45.36 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  45.36 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  45.36 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  44.85 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  41.78 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  43.68 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  44.85 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  39.5 
 
 		 210 aa  137  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  43.04 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  44.33 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  45.51 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  45.75 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  43.86 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.08 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  43.03 
 
 		 287 aa  134  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  44.08 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  47.2 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  45.4 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  37.11 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.61 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  41.92 
 
 		 231 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  48.44 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  44.17 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  44.17 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  47.69 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  40.72 
 
 		 297 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  35.26 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  48.44 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 275 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  41.1 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 226 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  49.65 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  41.1 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  45.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  49.65 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.49 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  32.5 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  37.1 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  39.56 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  36.26 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  37.8 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>