More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4099 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  74.27 
 
 
618 aa  968  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
623 aa  1284  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  74.64 
 
 
626 aa  983  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 
607 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 
647 aa  439  1e-122  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 
649 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 
649 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
609 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
611 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
610 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
633 aa  412  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 
606 aa  408  1e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
603 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 
601 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
606 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
606 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
651 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
646 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
661 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
607 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
633 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
617 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
655 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
610 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
644 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
645 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
682 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
597 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
651 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.7 
 
 
642 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
622 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
652 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
612 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
616 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  5.72274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 
596 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 
633 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
607 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 
650 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 
603 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
594 aa  360  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
605 aa  358  1e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
631 aa  357  4e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
654 aa  356  7e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
613 aa  356  8e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 
654 aa  353  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
649 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
602 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
602 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
604 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.44 
 
 
630 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
602 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
602 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
602 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
604 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
610 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  33.28 
 
 
630 aa  346  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
604 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
648 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
612 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
613 aa  343  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 
630 aa  343  8e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
610 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 
601 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
643 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
657 aa  341  3e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
642 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
653 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
643 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 
655 aa  338  1e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.43 
 
 
602 aa  337  3e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
648 aa  337  4e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
601 aa  336  8e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 
602 aa  336  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 
603 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
601 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
658 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
607 aa  333  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
610 aa  332  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
653 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
642 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
643 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
650 aa  330  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  31.22 
 
 
653 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.72 
 
 
610 aa  327  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 
610 aa  326  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
603 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
592 aa  325  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  33.51 
 
 
588 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  34.21 
 
 
601 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
601 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  31.6 
 
 
611 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 
601 aa  322  1e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
601 aa  322  2e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
661 aa  321  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
648 aa  321  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.64 
 
 
610 aa  321  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
604 aa  319  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
597 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
597 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
609 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>