More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3652 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  100 
 
 
387 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.44 
 
 
404 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  43.99 
 
 
404 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.67 
 
 
438 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  43.99 
 
 
404 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  43.99 
 
 
404 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  42.49 
 
 
391 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  43.48 
 
 
404 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.11 
 
 
404 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  42.13 
 
 
401 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  40.91 
 
 
404 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  40.25 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.04 
 
 
402 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  38.5 
 
 
407 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  39.79 
 
 
394 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  34.34 
 
 
422 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  39.19 
 
 
396 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  34.97 
 
 
414 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  37.85 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  44.33 
 
 
402 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  39.39 
 
 
421 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  36.32 
 
 
412 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  39.95 
 
 
420 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  39.23 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  36.41 
 
 
408 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  40.82 
 
 
397 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  35.99 
 
 
410 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  36.97 
 
 
413 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  35.68 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  38.17 
 
 
417 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  36.45 
 
 
412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.02 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.53 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  38.17 
 
 
411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  36.66 
 
 
404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  38.48 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  37.75 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.66 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.66 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  38.34 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  35.09 
 
 
411 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  36.39 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  33.94 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  38.13 
 
 
398 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  36.66 
 
 
416 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  38.52 
 
 
419 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.75 
 
 
420 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  38.48 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  38.97 
 
 
401 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  37.76 
 
 
402 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  38.04 
 
 
406 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  35.79 
 
 
416 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.25 
 
 
394 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.5 
 
 
394 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.34 
 
 
396 aa  230  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  37.85 
 
 
403 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.99 
 
 
421 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  35.48 
 
 
395 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  36.19 
 
 
421 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  39.54 
 
 
402 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.82 
 
 
404 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  38.19 
 
 
413 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  35.45 
 
 
419 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  35.27 
 
 
411 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  37.72 
 
 
402 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  38.19 
 
 
413 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.96 
 
 
422 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  37.28 
 
 
409 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  35.2 
 
 
394 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  35.31 
 
 
404 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  37.44 
 
 
403 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  34.01 
 
 
417 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  41.1 
 
 
399 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  36.07 
 
 
409 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  35.2 
 
 
394 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  35.22 
 
 
404 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.73 
 
 
404 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  35.73 
 
 
419 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.94 
 
 
419 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  37.73 
 
 
403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  37 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  35.37 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.9 
 
 
402 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  35.14 
 
 
410 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  37.21 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  35.63 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  35.11 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  37.63 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  36.86 
 
 
395 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  36.93 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  39.9 
 
 
409 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  37.5 
 
 
404 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  35.5 
 
 
419 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  36.25 
 
 
393 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  34.23 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  36.8 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  38.05 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  36.57 
 
 
462 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  32.66 
 
 
413 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  37.19 
 
 
425 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>