More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1589 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  70.04 
 
 		 229 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  69.03 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  63.52 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  63.37 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  65.25 
 
 		 249 aa  257  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.58 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  61.57 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  46.75 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  45.3 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  46.64 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  46.19 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  45.32 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  43.36 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  46.83 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  47.83 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  36.55 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  41.94 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.94 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  33.33 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  35.32 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  34.69 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  34.31 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  31.2 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  35.71 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  45.64 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  35.09 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  33.33 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  33.33 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  33.33 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  34.65 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  37.55 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  32.63 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  35.46 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  32.94 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  34.21 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  36.14 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  31.71 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.91 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.58 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  31.98 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  32.5 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  35.74 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  30.8 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  36.59 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  38.53 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  38.53 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  32.52 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  32.13 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  31.56 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.79 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  31.56 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  34.32 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  37.12 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  34.65 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  35.08 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  36.91 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  37.39 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  35.34 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  36.8 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  35.96 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  37.89 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  32.52 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  35.68 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  33.75 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  31.85 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  33.33 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  46.86 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  31.02 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  34.87 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  36.44 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  34.75 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  34.75 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  34.45 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  35.96 
 
 		 246 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  33.74 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  35.37 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  32.53 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>