More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0972 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  69.42 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  67.61 
 
 		 213 aa  286  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  68.72 
 
 		 212 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  66.51 
 
 		 224 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  63.33 
 
 		 212 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  66.01 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  66.01 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  61.61 
 
 		 213 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  66.83 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  56.8 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  51.24 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  49.29 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  48.13 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  48.82 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  48.82 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  48.11 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  47.87 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  47.87 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  47.39 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  48.34 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  48.34 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  43.6 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.92 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  44.98 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.11 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.27 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.11 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 440 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.83 
 
 		 378 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.66 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.66 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.66 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.14 
 
 		 382 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  41.4 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  40.67 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.61 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 411 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.12 
 
 		 383 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.7 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 591 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.15 
 
 		 427 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.18 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 452 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.65 
 
 		 369 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 449 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>