144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1120 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  100 
 
 		 309 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  47.7 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  47.1 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  47.1 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  46.13 
 
 		 335 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  45.48 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  44.31 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  37 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  35.69 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  35.49 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  34.16 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.79 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  32.86 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.74 
 
 		 332 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.39 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  32.51 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  32.5 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  33.67 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  33.67 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  31.79 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  32.89 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  32.89 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  34.23 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  34.23 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  32.26 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  33.91 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  33.33 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  31.08 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.48 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  30.68 
 
 		 356 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  31.49 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  30.68 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  30.24 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.76 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.28 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  31.37 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  26.79 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.82 
 
 		 388 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  27.69 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  27.27 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  27.24 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  27.8 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  29.58 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  26.9 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.32 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  25.17 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  25.55 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.83 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  24 
 
 		 363 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  27 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  24.75 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.72 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0022  hypothetical protein  26.12 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  28.62 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  24.24 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  24.24 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.11 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  24.24 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  25.89 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.41 
 
 		 349 aa  92.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  28.83 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  28.28 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  28.28 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  24.32 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  28.28 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  24.32 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  26.18 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.35 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  25.93 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  25.93 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  25.93 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  24.33 
 
 		 366 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  27.67 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.19 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  28.07 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.24 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  27.8 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.79 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  27.22 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  26.99 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>