119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0022 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  24.7 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  23.36 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  26.38 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  26.38 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  26.38 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  26.38 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  26.38 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  25.69 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  26.12 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  24.29 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  24.57 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  24.48 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  23.93 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  23.68 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  22.15 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  24.11 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  23.88 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  21.52 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  24.47 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  21.74 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  24.52 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  22.26 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  21.95 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.3 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  23.02 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  25.37 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  23.2 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  26.97 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  22.26 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  26.42 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  19.88 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  23.63 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  22.3 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  19.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  19.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  25.33 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  22 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  21.88 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  21.6 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  24.49 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  23.79 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  21.6 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  25.64 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  23.9 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  23.9 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  20.88 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  20.7 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  23.51 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.1 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  23.89 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  24.1 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  22.36 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  23.03 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  23.51 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  23.89 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  25.74 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  23.48 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  23.48 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  23.48 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  23.69 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  23.89 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  24.1 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  25.98 
 
 		 388 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  27.23 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  27.23 
 
 		 361 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  22.31 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  21.86 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  22.31 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  22.31 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  21.6 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  21.48 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  22.64 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  21.48 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  23.86 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  22.54 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  21.88 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  21.37 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  23.02 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  21.55 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  23.02 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  23.02 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  24.48 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  24.48 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.51 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  26.43 
 
 		 481 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  19.65 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  24.48 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  24.5 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  21.55 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  19.65 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  25.71 
 
 		 456 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  22.62 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  22.62 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  22.62 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  25.71 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>