More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00824 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  91.36 
 
 
602 aa  1164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 
601 aa  644  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  52.62 
 
 
601 aa  645  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  55.05 
 
 
601 aa  694  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  53.79 
 
 
601 aa  681  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  55.1 
 
 
588 aa  682  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  54.3 
 
 
601 aa  685  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  71.81 
 
 
611 aa  924  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  54.1 
 
 
602 aa  676  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  78.2 
 
 
601 aa  1002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1257  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  55.05 
 
 
601 aa  694  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  52.45 
 
 
599 aa  657  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  50.5 
 
 
598 aa  614  1e-174  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  50.67 
 
 
597 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
597 aa  602  1e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
597 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
597 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  50.08 
 
 
598 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 
598 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 
601 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 
601 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 
601 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 
601 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  51.42 
 
 
568 aa  584  1e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  49.83 
 
 
598 aa  583  1e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 
598 aa  583  1e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  47.72 
 
 
597 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  49.02 
 
 
597 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
633 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 
603 aa  406  1e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
633 aa  401  1e-110  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.48 
 
 
607 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  37.86 
 
 
587 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
603 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
592 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
603 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 
612 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
610 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
610 aa  363  7e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
610 aa  361  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
590 aa  360  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
607 aa  357  3e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  36.02 
 
 
592 aa  356  6e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
592 aa  356  8e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
609 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 
617 aa  352  9e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.5 
 
 
610 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
598 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
590 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
622 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
607 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.24 
 
 
610 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
610 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
612 aa  343  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
597 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
630 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
623 aa  337  3e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
606 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
606 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
613 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
606 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
649 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
605 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
647 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
607 aa  326  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
649 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
596 aa  323  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
592 aa  323  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
613 aa  322  2e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
626 aa  322  2e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
618 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
649 aa  320  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
604 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
594 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
663 aa  317  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
595 aa  317  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
602 aa  313  4e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
602 aa  312  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
604 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
637 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
610 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
609 aa  309  1e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 
652 aa  309  1e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
622 aa  308  2e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
604 aa  308  2e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
616 aa  308  2e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
608 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
602 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.88 
 
 
599 aa  305  1e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
602 aa  306  1e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 
604 aa  305  1e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
602 aa  306  1e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 
616 aa  304  2e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  5.72274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
605 aa  303  7e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.94 
 
 
606 aa  302  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
602 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 
611 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 
599 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 
599 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>