More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1142 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  100 
 
 		 166 aa  350  7e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  56.13 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  50.32 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  48.05 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  46.91 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  46.91 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  46.91 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  48.67 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  46.15 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  42.04 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  45.86 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  48.8 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  52.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  51.75 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  52.25 
 
 		 194 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  39.66 
 
 		 205 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  41.94 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  41.94 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  41.94 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  41.94 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  42.58 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  41.56 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  41.94 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  41.94 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  46.85 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  41.94 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  41.94 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  48.25 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  48.65 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  48.65 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  48.65 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  42.66 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  42.66 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  42.66 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  42.66 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  41.72 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  41.72 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  42.07 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  37.42 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  47.75 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 240 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  34.36 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.19 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 246 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  36.81 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 246 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  36.81 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 211 aa  98.2  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  41.53 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 193 aa  97.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 404 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  31.74 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 404 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  37.24 
 
 		 342 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  34.23 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 341 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 223 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 349 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  40.52 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  33.9 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>