286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0718 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  63.52 
 
 
312 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  62.09 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  46.65 
 
 
315 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  44.85 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  48.42 
 
 
307 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  43.41 
 
 
318 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  44.7 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  47.04 
 
 
313 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 
322 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  42.11 
 
 
549 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  44.81 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  45.3 
 
 
313 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  42.51 
 
 
305 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  40.51 
 
 
359 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  41.18 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  44.66 
 
 
309 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  39 
 
 
327 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.34 
 
 
329 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
371 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  39.87 
 
 
359 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
359 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
371 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
359 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
371 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  39.87 
 
 
371 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  42.81 
 
 
304 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  41.55 
 
 
339 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.68 
 
 
309 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  39.35 
 
 
350 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  39.5 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  38.56 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  38.56 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  38.56 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 
350 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.97 
 
 
334 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.23 
 
 
356 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.09 
 
 
310 aa  201  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.71 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  39.23 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  40.85 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.78 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.18 
 
 
330 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  42.28 
 
 
317 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
355 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 
328 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.68 
 
 
353 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.02 
 
 
309 aa  198  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.7 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.46 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.12 
 
 
329 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  36.7 
 
 
329 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.82 
 
 
329 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.82 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.12 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.05 
 
 
310 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.05 
 
 
310 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.05 
 
 
310 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.8 
 
 
329 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.05 
 
 
310 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.1 
 
 
339 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.71 
 
 
310 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.79 
 
 
320 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.79 
 
 
320 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 
314 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  43.66 
 
 
305 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  38.62 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  39.16 
 
 
344 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
310 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  38.28 
 
 
310 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  35.37 
 
 
389 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.37 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.57 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.93 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  37.1 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.03 
 
 
365 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  34.15 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  34.15 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  38.41 
 
 
334 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  37.38 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 
339 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.53 
 
 
307 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.31 
 
 
354 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
353 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.99 
 
 
316 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.99 
 
 
316 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.99 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  38.93 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>