270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1628 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
276 aa  547  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
286 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 
287 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 
286 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 
288 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
285 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
316 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
316 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 
274 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 
304 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
285 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 
274 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 
288 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 
317 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 
283 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
299 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
283 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
288 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 
267 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 
407 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 
283 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
288 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 
283 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.27 
 
 
296 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
274 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 
326 aa  99  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 
448 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.32 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.55 
 
 
281 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
274 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  34.15 
 
 
357 aa  92.8  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
329 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
291 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
330 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.81 
 
 
243 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 
334 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.4 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  25.54 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
353 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>