47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1484 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  100 
 
 		 221 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  77.88 
 
 		 221 aa  360  9e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  45.36 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  42.93 
 
 		 201 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  41.92 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  40.91 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  34.67 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  38.31 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  39.32 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  34.62 
 
 		 487 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  38.61 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  32.69 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  32.85 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  38.19 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  34.9 
 
 		 754 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  58.73 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  40 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  28.81 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  29.74 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  28.26 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  33.1 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  29.31 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  26.03 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  37.21 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  48 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  48.15 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  28.57 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  26.67 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  27.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  31.51 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  53.06 
 
 		 97 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  48.98 
 
 		 463 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  30.82 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  38.98 
 
 		 691 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  25 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  55.26 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  56.41 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  23.94 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  48.21 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  43.14 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  25.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01860  hypothetical protein  41.3 
 
 		 553 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.948924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  27.32 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  51.28 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  24.24 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09202  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  44.44 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>