More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0502 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 431 aa  855    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  50.58 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  49.31 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  49.31 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.03 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  46.79 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.2 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.84 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  46.49 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  43.02 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  44.08 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  43.46 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  43.09 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  42.79 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  42.86 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  42.43 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  41.22 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  42.96 
 
 		 444 aa  342  7e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  40.72 
 
 		 450 aa  335  7e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  42.06 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  41.41 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  42.63 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  42.95 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.59 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.24 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.1 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.33 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.87 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  37.41 
 
 		 561 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  40.14 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  37.58 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  39.16 
 
 		 542 aa  282  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  36.38 
 
 		 513 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  37.5 
 
 		 510 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  37.15 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.14 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.55 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.45 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  40.37 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.43 
 
 		 450 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  35.02 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  37.16 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  36.11 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  37.16 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  38.93 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  36.53 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  36.3 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.65 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  36.34 
 
 		 449 aa  255  9e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  35.13 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  36.16 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  34.94 
 
 		 439 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  36.6 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  33.96 
 
 		 518 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.68 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  36.36 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  35.83 
 
 		 522 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  35.1 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.92 
 
 		 470 aa  249  8e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  34.19 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  35.35 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  36.38 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  35.92 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  34.32 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  33.86 
 
 		 492 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.04 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.04 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.04 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.54 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  34.01 
 
 		 517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0047  signal recognition particle protein  35.76 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02143  signal recognition particle protein  36.3 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.74 
 
 		 478 aa  242  9e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0057  signal recognition particle protein  35.93 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  34.38 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  34.04 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  34.3 
 
 		 456 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  33.41 
 
 		 525 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  36.57 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  33.49 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.23 
 
 		 551 aa  239  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  31.52 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  35.19 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  34.47 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  33.33 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  36.77 
 
 		 450 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  34.92 
 
 		 453 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  33.87 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.01 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  34.2 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  36.36 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  33.79 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>