115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0080 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  100 
 
 
171 aa  345  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  36.65 
 
 
208 aa  122  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  35.4 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  40.74 
 
 
211 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  34.78 
 
 
203 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  32.92 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  32.73 
 
 
220 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  37.04 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  31.68 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  38.92 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  33.12 
 
 
208 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  33.13 
 
 
205 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  32.3 
 
 
203 aa  104  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  33.93 
 
 
207 aa  103  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  31.79 
 
 
207 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  32.53 
 
 
206 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  34.76 
 
 
205 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  31.61 
 
 
202 aa  101  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  31.14 
 
 
213 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  33.73 
 
 
210 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  29.63 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.18 
 
 
215 aa  98.2  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  30.43 
 
 
214 aa  97.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  29.73 
 
 
205 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  30.86 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  31.74 
 
 
201 aa  91.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 
240 aa  89.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  32.03 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  32.1 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  30.49 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  30.3 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  34.48 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  31.41 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  30.64 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  28.08 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.88 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  35.29 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  29.32 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  30.19 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  27.86 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  31.87 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  36.52 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  28.48 
 
 
211 aa  79  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  26.06 
 
 
214 aa  79  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  25.45 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  32.34 
 
 
229 aa  77.4  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  33.04 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  31.65 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  24.85 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  29.63 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  33.33 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  31.4 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  33.04 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  24.07 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  28.57 
 
 
205 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  33.02 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  30.23 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  31.71 
 
 
885 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  31.29 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.74 
 
 
1107 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  29.34 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  27.17 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  27.27 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  34.02 
 
 
307 aa  62  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  29.41 
 
 
191 aa  61.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  25.5 
 
 
233 aa  61.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26.22 
 
 
867 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  26.55 
 
 
230 aa  61.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  24.7 
 
 
199 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  27.85 
 
 
261 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  26.09 
 
 
254 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  23.49 
 
 
198 aa  57.8  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  27.27 
 
 
192 aa  57.4  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.45 
 
 
937 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.45 
 
 
937 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  25.41 
 
 
197 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  25.9 
 
 
199 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  23.43 
 
 
216 aa  54.7  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  26.22 
 
 
186 aa  54.7  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  54.7  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  32.77 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  32.77 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  29.31 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  23.49 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  26.17 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  24 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  24.29 
 
 
199 aa  52.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  25.66 
 
 
925 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  22.91 
 
 
199 aa  52  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  26.87 
 
 
212 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  24.14 
 
 
230 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.97 
 
 
1041 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  22.94 
 
 
341 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  21.67 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  24.84 
 
 
216 aa  48.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.63 
 
 
863 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  27.21 
 
 
158 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>