More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3123 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  69.43 
 
 		 423 aa  276  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  65.05 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  65.05 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  65.05 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  60.62 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  63.98 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  60.94 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  60.41 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  59.9 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  61.96 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  60.61 
 
 		 200 aa  218  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  54.97 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  56.48 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  55.22 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  58.46 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  51.28 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  50.27 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  44.81 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 259 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  38.1 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  33.03 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.14 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  33.03 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 996 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 264 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  33.04 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  33.04 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  32.14 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  33.04 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.32 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  30.36 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.19 
 
 		 390 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  36.26 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.24 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  33.03 
 
 		 400 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 246 aa  51.2  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 261 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.08 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.72 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  28.4 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  38.06 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  37.18 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  25 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  29.57 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  29.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>