More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0686 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 424 aa  874    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  84.12 
 
 		 422 aa  756    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  78.44 
 
 		 427 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  73.92 
 
 		 423 aa  670    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  78.67 
 
 		 427 aa  684    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  63.72 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 		 410 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  66.02 
 
 		 413 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 411 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  63.37 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  63.1 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 418 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 413 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 		 413 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.72 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.72 
 
 		 414 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  60.86 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  64.49 
 
 		 414 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 438 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 416 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>