More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2453 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  28.32 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  27.97 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  29.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  26.67 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  28.67 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  29.64 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  25.61 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.52 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  29.28 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29.66 
 
 		 321 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.36 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.3 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  27.6 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  27.17 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.43 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  26.07 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.96 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  24.21 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  26.29 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  24.38 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  25.71 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  25.09 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  25.99 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  24.91 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  23.08 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  23.08 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  24.19 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  22.34 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  25 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.72 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  31.54 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.59 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.51 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  38 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.97 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.02 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.18 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.4 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.98 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  32.14 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.19 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  38.05 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.82 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.71 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  35.92 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.67 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.35 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  33.93 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.18 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  33.93 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  35 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.86 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  45.83 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.74 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.63 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.74 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.48 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  35.35 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  31.43 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 177 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.34 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.19 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.78 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  45.21 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>