271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1819 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
333 aa  682    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  48.81 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  51.03 
 
 
323 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  36.97 
 
 
342 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
315 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.97 
 
 
334 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
312 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.17 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.58 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  35.97 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.09 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
318 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
337 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 
337 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
309 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
307 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.48 
 
 
319 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 
319 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
313 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.96 
 
 
335 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.96 
 
 
335 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
321 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
304 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 
314 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  30.56 
 
 
312 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
321 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  29.19 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.35 
 
 
438 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
326 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  29.32 
 
 
298 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  24.75 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.14 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.72 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  26.56 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.48 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
264 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.09 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.7 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
339 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  30.52 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
319 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.24 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.2 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.7 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  27.85 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.62 
 
 
316 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.62 
 
 
316 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
315 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.41 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
597 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.74 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>