More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4433 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  61.06 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  61.13 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  57.68 
 
 		 301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  56.31 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  40.87 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.54 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  47.81 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  37.7 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.38 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.18 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  34.43 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.89 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.55 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>