More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3743 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  67.63 
 
 		 689 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  55.67 
 
 		 697 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  53.96 
 
 		 759 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  56.4 
 
 		 719 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  56.41 
 
 		 685 aa  641    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  63.6 
 
 		 712 aa  855    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  58.33 
 
 		 694 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.08 
 
 		 704 aa  643    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  53.13 
 
 		 717 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  58 
 
 		 787 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.46 
 
 		 709 aa  718    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  62.8 
 
 		 708 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  54.52 
 
 		 707 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  53.95 
 
 		 697 aa  666    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  55.94 
 
 		 736 aa  705    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.42 
 
 		 710 aa  641    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  55.48 
 
 		 670 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  55.84 
 
 		 684 aa  653    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  54.86 
 
 		 714 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  57.81 
 
 		 674 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  67.1 
 
 		 682 aa  848    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  55.99 
 
 		 685 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  52.68 
 
 		 700 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 702 aa  1395    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  57.49 
 
 		 701 aa  756    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  54.7 
 
 		 726 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  54.58 
 
 		 717 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  56.57 
 
 		 688 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  55.6 
 
 		 719 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  54.86 
 
 		 707 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  55.24 
 
 		 710 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  54.86 
 
 		 707 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.07 
 
 		 699 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  50.72 
 
 		 690 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  61.08 
 
 		 876 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  45.31 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.52 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.26 
 
 		 715 aa  277  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 744 aa  271  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.02 
 
 		 742 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  34.17 
 
 		 739 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.82 
 
 		 686 aa  265  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.3 
 
 		 714 aa  264  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 625 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.92 
 
 		 706 aa  264  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  29.91 
 
 		 689 aa  264  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.84 
 
 		 718 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.68 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 807 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.93 
 
 		 762 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 		 735 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.3 
 
 		 797 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 687 aa  250  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 682 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.22 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  33.19 
 
 		 795 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 790 aa  248  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  39.84 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 798 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  34.75 
 
 		 797 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.94 
 
 		 795 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  31.77 
 
 		 620 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 706 aa  244  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 797 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  31.95 
 
 		 728 aa  244  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.65 
 
 		 729 aa  243  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 743 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  32.42 
 
 		 746 aa  240  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  31.67 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 762 aa  234  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 817 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.27 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.37 
 
 		 735 aa  233  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.03 
 
 		 816 aa  233  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  32.25 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 		 616 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.15 
 
 		 759 aa  231  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.04 
 
 		 760 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  32.36 
 
 		 797 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  29.81 
 
 		 630 aa  227  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.98 
 
 		 755 aa  227  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 779 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 726 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 787 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  28.97 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 816 aa  225  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 668 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.49 
 
 		 768 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 825 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  34.56 
 
 		 678 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.25 
 
 		 713 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.97 
 
 		 678 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.76 
 
 		 1089 aa  223  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 755 aa  223  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.88 
 
 		 669 aa  221  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  34.91 
 
 		 707 aa  220  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  29.01 
 
 		 724 aa  220  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>