293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1954 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 501 aa  971    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  54.66 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  44.26 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  43 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  40.49 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  38.32 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  38.28 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  42.18 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  37.88 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  37.91 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  40.79 
 
 		 497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  38.41 
 
 		 497 aa  312  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  43.48 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  35.77 
 
 		 495 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  39.22 
 
 		 483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  38.6 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  37.58 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  36.25 
 
 		 501 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  36.25 
 
 		 501 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  36.16 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  37.95 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  36.14 
 
 		 484 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  37 
 
 		 489 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  35.23 
 
 		 486 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  35.34 
 
 		 507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  38.48 
 
 		 482 aa  266  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  36.19 
 
 		 528 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  38.23 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.91 
 
 		 501 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  36.34 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  32.48 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  34.41 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  34.19 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  33.48 
 
 		 516 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  37.08 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.84 
 
 		 527 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.55 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  32.59 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 		 524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  30.9 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  32.34 
 
 		 516 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  31.59 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  31.59 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  34.7 
 
 		 491 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  34 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  31.34 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  34.7 
 
 		 489 aa  226  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  32.01 
 
 		 533 aa  226  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  35.56 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  34.96 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  31.35 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  33.62 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.84 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  33.86 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  33.86 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 		 501 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  30.04 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  34.73 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  31.53 
 
 		 461 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.3 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  33.84 
 
 		 489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  33.84 
 
 		 489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  32.56 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.78 
 
 		 461 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  33.19 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  30.28 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 510 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.49 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  30.96 
 
 		 504 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  31.22 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  34.03 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  31.07 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.74 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.8 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.8 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.8 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.8 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  30.59 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  30.13 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  31.92 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.01 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  30.8 
 
 		 511 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.08 
 
 		 497 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>