More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1717 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  100 
 
 
409 aa  801    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  74.45 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  59.76 
 
 
415 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  59.85 
 
 
407 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  56.93 
 
 
424 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  53.81 
 
 
449 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  52.85 
 
 
428 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  54.52 
 
 
413 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  52.34 
 
 
441 aa  352  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  50.73 
 
 
469 aa  342  5e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  52.01 
 
 
447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  48.45 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  53.57 
 
 
433 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  51.85 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  45.6 
 
 
465 aa  279  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  42.33 
 
 
462 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  39.42 
 
 
487 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  40.14 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  39.2 
 
 
482 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  36.63 
 
 
461 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.25 
 
 
460 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.51 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.82 
 
 
485 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  47.19 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  48.7 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.29 
 
 
464 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.29 
 
 
464 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  36.69 
 
 
469 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.03 
 
 
464 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.03 
 
 
464 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.03 
 
 
464 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  44.87 
 
 
393 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  48.85 
 
 
377 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  44.53 
 
 
403 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.03 
 
 
464 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  37.53 
 
 
455 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.03 
 
 
464 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.77 
 
 
464 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.77 
 
 
464 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.94 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  36.74 
 
 
486 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.97 
 
 
481 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  45.76 
 
 
403 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.14 
 
 
451 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.59 
 
 
477 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.59 
 
 
476 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.59 
 
 
476 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.91 
 
 
484 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.91 
 
 
484 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  49.6 
 
 
394 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.91 
 
 
492 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  42.48 
 
 
390 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  38.53 
 
 
399 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  38.35 
 
 
399 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.39 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.75 
 
 
445 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  38.66 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.08 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  35.59 
 
 
554 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  38.19 
 
 
399 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.37 
 
 
399 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.39 
 
 
481 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.37 
 
 
399 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  43.02 
 
 
425 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  38.01 
 
 
399 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.62 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  46.53 
 
 
383 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  36.68 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  44.03 
 
 
495 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.85 
 
 
451 aa  189  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  38.46 
 
 
365 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  41.09 
 
 
391 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  38.01 
 
 
399 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  43.1 
 
 
484 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  38.01 
 
 
399 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  49.79 
 
 
414 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.06 
 
 
483 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.6 
 
 
473 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.84 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  41.53 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  35.89 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.26 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  40.46 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  35.84 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  31.89 
 
 
506 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  35.84 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  35.84 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  35.84 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  38.94 
 
 
365 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  38.94 
 
 
365 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.92 
 
 
476 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  35.55 
 
 
391 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  41.94 
 
 
372 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  35.63 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38.05 
 
 
365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  34.97 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  34.97 
 
 
391 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  34.97 
 
 
391 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  33.42 
 
 
395 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  38.76 
 
 
365 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.6543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>