168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1308 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1308  CheD  100 
 
 		 163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  46.54 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  44.17 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.04 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  46.2 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  46.25 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  47.8 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.1 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  45.51 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.77 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.08 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.08 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.42 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  44.24 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  43.04 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  39.26 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.59 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.79 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.79 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.38 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  42.86 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  45.26 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  38.61 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.25 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50.4 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.6 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  39.47 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.33 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.67 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  38.99 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.16 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  40.12 
 
 		 205 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.71 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.6 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.54 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.54 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.91 
 
 		 220 aa  99  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.59 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  37.06 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.86 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.13 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.26 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  35.48 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.71 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  33.78 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.65 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  33.11 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.11 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  35.11 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  32.12 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.82 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0963  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.07 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.33 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.04 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  30.77 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  35.66 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.53 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.81 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  27.34 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.94 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.77 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  28.85 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.81 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  29.38 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.72 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  30.56 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  31.91 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.78 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.14 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.92 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  32.82 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  29.71 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.62 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.73 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.46 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  26.99 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  32.14 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  31.62 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.28 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.58 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.65 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.59 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  29.58 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  31.3 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0620  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.76 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.595849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  30.6 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.1 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.87 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.58 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.5 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.58 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.3 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>