155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0431 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  351  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  42.95 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  44.67 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.93 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.94 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.81 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.75 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  36.84 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.74 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  36.42 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  33.96 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.06 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  40.56 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.66 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.85 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.85 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.04 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  35.26 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.3 
 
 		 137 aa  84.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.86 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  33.11 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.87 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  33.58 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.26 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.14 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.65 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.24 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  32.24 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.86 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  31.37 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.08 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  34.78 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.46 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  34.64 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  31.79 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.87 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.61 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  34.07 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  30.07 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  30.61 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.8 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  34.04 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.92 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.62 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2845  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.8 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244077  normal  0.188439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.77 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  32.06 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  32.06 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.04 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.95 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.37 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.95 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 247 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 247 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.16 
 
 		 247 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  27.78 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.88 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  28.21 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  28.48 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1395  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.26 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.71 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.93 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0160  chemotaxis protein CheD  34.68 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.52 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  31.01 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.46 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.46 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.98 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0208  chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.48 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.95 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.46 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.85 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.27 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.56 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>