163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3472 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  39.07 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  42.57 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.75 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.09 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  36.24 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  33.12 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  37.06 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.12 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.76 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  37.25 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.71 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.71 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.36 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  32.89 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  35.66 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  34.85 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  35.1 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.19 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.92 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.45 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.37 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.53 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  36.84 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.13 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  31.85 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.92 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  30.52 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.85 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.99 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.2 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.92 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.92 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.92 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.1 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.25 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  29.45 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.77 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.11 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.15 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.26 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.79 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  31.75 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  34.06 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.81 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  29.01 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.07 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.83 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.22 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.81 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.71 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.43 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  30.94 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  34.81 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  30.3 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.5 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.03 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  28.99 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.82 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.89 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.5 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.41 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.56 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  28.35 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.87 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.78 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.62 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.01 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.79 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.97 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.99 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.39 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.39 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.39 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.39 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.28 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  25.2 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.27 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.21 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  32.35 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.45 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.71 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.71 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.66 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.58 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.4 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.92 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.45 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.15 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.34 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>