167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0260 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  98.79 
 
 
247 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  99.6 
 
 
247 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  90.28 
 
 
241 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  90.12 
 
 
253 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  80.73 
 
 
273 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  89.33 
 
 
253 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  78.8 
 
 
234 aa  351  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.8 
 
 
234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  76.4 
 
 
234 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  77.13 
 
 
263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  72.46 
 
 
250 aa  334  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  73.82 
 
 
271 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  58.94 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  64.29 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  57.87 
 
 
202 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  54.55 
 
 
203 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  56.28 
 
 
217 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  55.49 
 
 
206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  50.51 
 
 
233 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  51.26 
 
 
201 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  49.49 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50 
 
 
206 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  49.49 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.96 
 
 
208 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49.49 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50 
 
 
234 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  56.33 
 
 
242 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49.25 
 
 
206 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49 
 
 
206 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  53.8 
 
 
245 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47 
 
 
206 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  54.32 
 
 
227 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  51.14 
 
 
219 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50.52 
 
 
194 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49.17 
 
 
245 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49.48 
 
 
206 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  49.17 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  55.41 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  51.37 
 
 
200 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  50.28 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  50 
 
 
198 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.75 
 
 
218 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  43.13 
 
 
209 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  48.17 
 
 
178 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  46.2 
 
 
216 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  46.51 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.15 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  49.21 
 
 
213 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.65 
 
 
191 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  42.42 
 
 
209 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0160  chemotaxis protein CheD  46.2 
 
 
195 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.92 
 
 
184 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0208  chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins  40.82 
 
 
200 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  46.58 
 
 
197 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0240  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43 
 
 
183 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.497247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.79 
 
 
184 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  43.6 
 
 
169 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.29 
 
 
184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.67 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  49.66 
 
 
188 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3628  hypothetical protein  46.62 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0550026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2713  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  48.8 
 
 
190 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.98 
 
 
183 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.87 
 
 
199 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1042  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.37 
 
 
183 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  42.28 
 
 
191 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.87 
 
 
199 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3472  CheD  40.35 
 
 
171 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  41.67 
 
 
185 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  40 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.11 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  43.24 
 
 
199 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1791  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.34 
 
 
199 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  40.34 
 
 
197 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0963  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.55 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.13 
 
 
171 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.79 
 
 
171 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.25 
 
 
198 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  42.34 
 
 
168 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2845  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.86 
 
 
161 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244077  normal  0.188439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  38.82 
 
 
171 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  41.54 
 
 
170 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  38.67 
 
 
161 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.85 
 
 
198 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.44 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
159 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.15 
 
 
157 aa  95.5  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.15 
 
 
157 aa  95.5  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.42 
 
 
160 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.37 
 
 
156 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.04 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  36.73 
 
 
170 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.04 
 
 
166 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>