More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0592 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  72.51 
 
 
411 aa  657    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
411 aa  844    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  62.77 
 
 
411 aa  570  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  61.56 
 
 
411 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
411 aa  548  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  57.18 
 
 
413 aa  488  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.65 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
395 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.06 
 
 
446 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 
437 aa  302  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  40.66 
 
 
436 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 
403 aa  297  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
416 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  40.36 
 
 
611 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 
438 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
395 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
395 aa  289  7e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.07 
 
 
436 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
399 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 
401 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  37.19 
 
 
433 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 
396 aa  285  8e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.11 
 
 
463 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.44 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 
438 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  38.25 
 
 
439 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.66 
 
 
401 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 
435 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.23 
 
 
433 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
386 aa  277  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.08 
 
 
440 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.14 
 
 
440 aa  275  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.49 
 
 
393 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.99 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
401 aa  275  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  39.39 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.82 
 
 
394 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.31 
 
 
417 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.89 
 
 
393 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
441 aa  269  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  38.78 
 
 
416 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.14 
 
 
398 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
441 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.99 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
393 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
393 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
393 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.16 
 
 
430 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.25 
 
 
400 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.46 
 
 
406 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
398 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.24 
 
 
404 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  38.35 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
403 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.98 
 
 
437 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.39 
 
 
397 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 
432 aa  259  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
393 aa  259  8e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
404 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
437 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
399 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.48 
 
 
416 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
397 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 
398 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.25 
 
 
394 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.76 
 
 
397 aa  243  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  37.31 
 
 
398 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 
395 aa  243  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.62 
 
 
406 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  36.69 
 
 
407 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
402 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
388 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 
402 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  34.31 
 
 
410 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  35.17 
 
 
390 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
398 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  34.06 
 
 
410 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  39.49 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
406 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.67 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>