More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0055 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  67.29 
 
 		 214 aa  304  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  74.3 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  73.83 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  73.36 
 
 		 222 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  69.01 
 
 		 215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  56.22 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  49.31 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.31 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  49.3 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.58 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  47.52 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  48.51 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  48.02 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.17 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  49.06 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  47.76 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  47.78 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  47.47 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  47.14 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.19 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  46.53 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  50 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.08 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  49.51 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.72 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.32 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.62 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  46.73 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  46.12 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.47 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  46.73 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.72 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  39.5 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  42.11 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.76 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  45.58 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  41.15 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.86 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  35.38 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  39.87 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  42.45 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  42.06 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  44.55 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  38.53 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  38.53 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.12 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.74 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.05 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  37.96 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.13 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  37.29 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  37.29 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  23.96 
 
 		 812 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  35.59 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.74 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.84 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.73 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  34.51 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  34.58 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.06 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  37.61 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  30.05 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.22 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  28.04 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.06 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  33 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  25.71 
 
 		 814 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.58 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  38 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.85 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  33.64 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  33 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.91 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.67 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.06 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  34.29 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  33.02 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  32.2 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  33 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  31.53 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.5 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  24.79 
 
 		 835 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  24.79 
 
 		 835 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  24.79 
 
 		 843 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  27.98 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  23.83 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  22.62 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  29.73 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  22 
 
 		 803 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  29.05 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  30.26 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  34.04 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>