41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0008 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0008  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit, putative  100 
 
 		 1025 aa  2070    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.14 
 
 		 1184 aa  74.7  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.72 
 
 		 1164 aa  68.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.45 
 
 		 1150 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  20.44 
 
 		 1075 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.24 
 
 		 1270 aa  61.6  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.92 
 
 		 1270 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.44 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.17 
 
 		 1166 aa  58.9  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  23.47 
 
 		 1127 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.04 
 
 		 1158 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.23 
 
 		 1187 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.2 
 
 		 1260 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1260 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.89 
 
 		 1274 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.13 
 
 		 1163 aa  56.2  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.43 
 
 		 1226 aa  55.5  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.97 
 
 		 1054 aa  54.7  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.13 
 
 		 1270 aa  54.7  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.21 
 
 		 1198 aa  54.3  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.22 
 
 		 1091 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  21.21 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.89 
 
 		 1158 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.01 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.03 
 
 		 1162 aa  52  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.81 
 
 		 1160 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.6 
 
 		 1085 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.2 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.91 
 
 		 1077 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.64 
 
 		 1160 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20 
 
 		 1138 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  21.13 
 
 		 1060 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.08 
 
 		 1192 aa  49.3  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.83 
 
 		 1269 aa  48.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.71 
 
 		 1190 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.72 
 
 		 1234 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.23 
 
 		 1061 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.95 
 
 		 1158 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.17 
 
 		 1063 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.38 
 
 		 1234 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.69 
 
 		 1236 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>