More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10062 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  100 
 
 
479 aa  961  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.26 
 
 
487 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13387  hypothetical protein  54.74 
 
 
264 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.35378e-05  hitchhiker  0.00872063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.26 
 
 
474 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.83 
 
 
448 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.46 
 
 
532 aa  166  1e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.4 
 
 
449 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  34.35 
 
 
480 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  9.29143e-06  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 
466 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
479 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 
479 aa  154  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.52 
 
 
448 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.91 
 
 
444 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.11 
 
 
463 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13388  oxidoreductase  70.73 
 
 
123 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0659684  normal  0.0431971 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
479 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.83 
 
 
461 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  26.91 
 
 
444 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.62 
 
 
461 aa  148  2e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  29.28 
 
 
479 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 
462 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.07 
 
 
448 aa  142  2e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 
490 aa  140  4e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.2 
 
 
542 aa  139  9e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.07 
 
 
462 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 
451 aa  138  3e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.02 
 
 
463 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.62 
 
 
464 aa  137  6e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 
492 aa  137  6e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.08 
 
 
461 aa  136  7e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.02 
 
 
478 aa  136  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.11 
 
 
451 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.08 
 
 
474 aa  135  1e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.73 
 
 
459 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.79 
 
 
469 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  29.59 
 
 
501 aa  134  4e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 
476 aa  130  5e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 
495 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  30.21 
 
 
499 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.96481e-14 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 
472 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 
458 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  30.43 
 
 
563 aa  122  2e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.66 
 
 
328 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.56 
 
 
705 aa  120  4e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  36.48 
 
 
446 aa  120  5e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
456 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.36 
 
 
468 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  40.3 
 
 
471 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.19 
 
 
460 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
477 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.62 
 
 
461 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 
444 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25.9 
 
 
473 aa  116  9e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  29.47 
 
 
466 aa  115  2e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
469 aa  115  2e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 
465 aa  115  2e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  28.99 
 
 
456 aa  115  2e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 
490 aa  115  2e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 
466 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.61 
 
 
478 aa  113  7e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.3 
 
 
473 aa  112  1e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
462 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.61 
 
 
752 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
574 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
614 aa  110  7e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
489 aa  110  7e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 
864 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 
465 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
864 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
864 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  27.97 
 
 
476 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.88 
 
 
465 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
477 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 
891 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
896 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 
896 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 
602 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  42.29 
 
 
545 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
896 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  28.05 
 
 
471 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  26.07 
 
 
566 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  33.88 
 
 
894 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  33.67 
 
 
459 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  33.33 
 
 
577 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  24.46 
 
 
491 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.9 
 
 
734 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 
454 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  28 
 
 
758 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.18 
 
 
473 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  28.01 
 
 
461 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  31.31 
 
 
982 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 
456 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 
456 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 
445 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.63 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  27.88 
 
 
448 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.29 
 
 
764 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>