26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13387 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13387  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000235378  hitchhiker  0.00872063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  54.74 
 
 		 479 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  36.59 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 532 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  24.69 
 
 		 448 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  24 
 
 		 444 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  24 
 
 		 444 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 466 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.04 
 
 		 448 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 		 479 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 542 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 		 456 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  26.32 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.28 
 
 		 490 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  24.16 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  26.26 
 
 		 479 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.43 
 
 		 445 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 480 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 		 459 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  23.2 
 
 		 501 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.72 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  30.3 
 
 		 775 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 451 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.68 
 
 		 476 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  26.79 
 
 		 463 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>