171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13388 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13388  oxidoreductase  100 
 
 
123 aa  241  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0659684  normal  0.0431971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  70.73 
 
 
479 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.21 
 
 
449 aa  94  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  50 
 
 
448 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
574 aa  90.5  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 
446 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  42.57 
 
 
563 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  59.04 
 
 
462 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  43.7 
 
 
487 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  57.32 
 
 
461 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  56.63 
 
 
462 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.98 
 
 
472 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.89 
 
 
474 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  46.43 
 
 
705 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  58.7 
 
 
532 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  52.44 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.22 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.14 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.69 
 
 
464 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  57.69 
 
 
468 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  55.56 
 
 
479 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  55.56 
 
 
479 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  54.88 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  48.91 
 
 
461 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  64.71 
 
 
466 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
458 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  43.27 
 
 
473 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.84 
 
 
451 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  48.35 
 
 
474 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  50 
 
 
448 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  50.65 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.41 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  53.01 
 
 
499 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  47 
 
 
448 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  39.47 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  38.6 
 
 
444 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  51.95 
 
 
479 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  55.41 
 
 
465 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  51.14 
 
 
501 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.44 
 
 
466 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  50 
 
 
463 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.79 
 
 
492 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.79 
 
 
490 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  44.79 
 
 
328 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  44.19 
 
 
448 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 
614 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 
864 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 
864 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 
864 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  49.35 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  48.78 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  41.05 
 
 
577 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.51 
 
 
542 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 
891 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.14 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.18 
 
 
484 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  47.25 
 
 
463 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  46.38 
 
 
982 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  44.79 
 
 
449 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.65 
 
 
462 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08405  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  38.83 
 
 
596 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  54.88 
 
 
456 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.96 
 
 
491 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
896 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
896 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
896 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.65 
 
 
465 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  53.25 
 
 
545 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  43.04 
 
 
436 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  44 
 
 
459 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  60 
 
 
461 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.79 
 
 
476 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  36.96 
 
 
894 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  41.24 
 
 
566 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  56.9 
 
 
456 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.98 
 
 
490 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 
476 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  46.43 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 
459 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  55.21 
 
 
451 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
447 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  41.84 
 
 
436 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 
462 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  39.51 
 
 
462 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.51 
 
 
462 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  56.9 
 
 
458 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  55.56 
 
 
466 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  41.46 
 
 
454 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.07 
 
 
726 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  47.89 
 
 
465 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  43.22 
 
 
495 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 
462 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  52.54 
 
 
465 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  57.69 
 
 
473 aa  58.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  56.41 
 
 
456 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 
574 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  45.21 
 
 
439 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 
462 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  53.66 
 
 
476 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  53.62 
 
 
467 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>