126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1685 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  313  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  62.67 
 
 		 150 aa  203  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  44.3 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  40.82 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  38.19 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  40.97 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  34.25 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  36.81 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  106  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  32.87 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  33.57 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  34.97 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  42.53 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  30.15 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  27.34 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.84 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  29.93 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  40.68 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.17 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.94 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  26.17 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.93 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.13 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.45 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  23.08 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  29.73 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  28.37 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  21.15 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  24.64 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  27.08 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  24.64 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  25.17 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.67 
 
 		 1345 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.67 
 
 		 1372 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  32.94 
 
 		 231 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.38 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  29.13 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  25.33 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  24.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.36 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  24.36 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  24.46 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  35.79 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  23.53 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  21.74 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  24.72 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  21.9 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  24.82 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  23.61 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  24.11 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  21.89 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  25.38 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  22.92 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  28.04 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  24.12 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  21.43 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  23.91 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  26.9 
 
 		 231 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  25.35 
 
 		 258 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  25.35 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25.71 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.17 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.72 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  26.74 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  24.11 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  24.82 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.08 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  23.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  24.82 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  23.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  29.79 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  25.76 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  23.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  30.77 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  25.95 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  26.76 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  26.32 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  23.24 
 
 		 282 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  23.13 
 
 		 260 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  22.67 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  23.24 
 
 		 305 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  22.56 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>