More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  82.79 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  76.03 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  73.47 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  74.38 
 
 		 257 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  69.35 
 
 		 257 aa  355  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  71.78 
 
 		 262 aa  350  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  70.2 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  67.62 
 
 		 244 aa  340  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  67.89 
 
 		 255 aa  331  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  65.22 
 
 		 260 aa  331  7.000000000000001e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  71.25 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.33 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  62.04 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  61.25 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  61.16 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.08 
 
 		 246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.56 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 244 aa  304  8.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.58 
 
 		 244 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.68 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  63.6 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  60.58 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.17 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  61.09 
 
 		 256 aa  299  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60.74 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.42 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 247 aa  299  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  61.41 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.96 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  62.34 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.76 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.79 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  56.07 
 
 		 363 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  56.07 
 
 		 363 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.38 
 
 		 269 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.52 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 269 aa  294  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  56.79 
 
 		 247 aa  294  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.67 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  58.85 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.8 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.02 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  54.81 
 
 		 360 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.68 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  59.17 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  59.52 
 
 		 267 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  57.6 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 249 aa  291  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  59.2 
 
 		 256 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  58.75 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.5 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  56.07 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  56.07 
 
 		 363 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  59.34 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  59.43 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  56.56 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.38 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.61 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  58.61 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  61.54 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  59.76 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>