More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  67.33 
 
 		 302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  66.67 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  64.33 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  64.33 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  64.33 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  56.19 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  51.17 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  51.33 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  48.16 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  47.67 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  46.33 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  49.15 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  51 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  48.8 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  42.38 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.47 
 
 		 461 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  55.65 
 
 		 118 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.47 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.48 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  32.87 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  32.72 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  32.01 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.07 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  32.12 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.62 
 
 		 475 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.78 
 
 		 411 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  29.43 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.14 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 339 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 339 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  32.14 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  29.54 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  39.17 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  40.17 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  29.72 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  28.2 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  29.27 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.73 
 
 		 639 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  27.66 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  25.8 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  47.57 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.13 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.13 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>