More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3141 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  87.12 
 
 
274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  65.77 
 
 
286 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  62.16 
 
 
276 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  59.32 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  60.15 
 
 
316 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  60.62 
 
 
282 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  59.92 
 
 
268 aa  298  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.04 
 
 
278 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  58.08 
 
 
262 aa  294  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.61 
 
 
304 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  57.83 
 
 
283 aa  285  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  56.37 
 
 
274 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  57.85 
 
 
266 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  55.3 
 
 
276 aa  278  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  55.56 
 
 
284 aa  278  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  61.26 
 
 
277 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  56.15 
 
 
265 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  55.3 
 
 
293 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 
299 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  51.5 
 
 
269 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  50 
 
 
300 aa  242  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  35.22 
 
 
256 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  25.38 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
260 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  29.67 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.85 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
237 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.16 
 
 
236 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  32.09 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.39 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.11 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  43.97 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.78 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.46 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.98 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.01 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.18 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.18 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  32.47 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.26 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.5 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.03 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  30.04 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  22.83 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.47 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  22.83 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  22.83 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.13 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.29 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  27.04 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.5 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  29.74 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40.34 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.68 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  22.83 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.27 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  22.44 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.29 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  22.44 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  29.3 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>