More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1611 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 433 aa  894    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  77.14 
 
 		 431 aa  718    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  51.54 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  51.74 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  51.52 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  51.16 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  48.82 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  44.74 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  43.71 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  33.85 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  35.23 
 
 		 358 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  36.48 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  31.06 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  34.83 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  34.24 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  33.83 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  33.17 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3366  Glycine/serine hydroxymethyltransferase  32.85 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  31.76 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  32.49 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  34.64 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  31.66 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  33.98 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  32.66 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  33.17 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  32.76 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  32.91 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  32.83 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  32.91 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  32.68 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  32.67 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  32.67 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  32.58 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl106  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  33.5 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  34.35 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  33.68 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  32.12 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  32.34 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  33.42 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  32.08 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  33.08 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  32.67 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  32.8 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  32.2 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf743  serine hydroxymethyltransferase  31.13 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  32.92 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  32.3 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  31.9 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  32.06 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  31.39 
 
 		 415 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  33.66 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  33.87 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  32.33 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  33.42 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  32.33 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  33.83 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  33.08 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  31.94 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  32.33 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  33.92 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  33.01 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  31.18 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  32.33 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  33 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  33.99 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  33.42 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  33.99 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  33.15 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  33.24 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  32.2 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  31.31 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  32.08 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  33.85 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  31.49 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  33.07 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  30.35 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  33.17 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  31.08 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  32.91 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  32.75 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  31 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  33.99 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  32.49 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  31.72 
 
 		 414 aa  193  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>