More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3925 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  45.45 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  40.51 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  42.63 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  39.85 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  38.07 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  36.57 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  39.85 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  37.56 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  36.34 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  33.97 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  34.27 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  35.4 
 
 		 358 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  30.1 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  32.61 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  35.09 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3707  serine hydroxymethyltransferase  32.03 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990227  normal  0.0196042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  32.61 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  34.03 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  35.56 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  37.02 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  34.5 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  33.86 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  35.53 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  30.56 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  33.6 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  33.6 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  32.49 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  32.91 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  31.01 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  32.73 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  34.39 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  34.41 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  32.73 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  31.85 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  32.74 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  33.88 
 
 		 433 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  31.61 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  32.18 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  31.44 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  32.04 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  32.82 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  32.14 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  30.46 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  31.67 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  32.45 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  31.27 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  32.73 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  32.2 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  35.81 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  35.36 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  32.12 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  32.78 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  31.32 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  32.5 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  33.6 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  31.77 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  30.18 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  33.77 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  31.59 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  32.98 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  31.25 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  32.15 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  32.47 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  32.35 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  33.24 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  32.61 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  32.04 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  31.51 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  33.92 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  34.32 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  32.79 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  33.93 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  31.72 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  32.88 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  32.22 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  33.08 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>