More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0061 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 433 aa  890    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  52.57 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  48.82 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  49.2 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  45.61 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  46.59 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  45.52 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  45.87 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  46 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  44.74 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  40.28 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  40.62 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 414 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  40.51 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  38.27 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  39.55 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  36.67 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  38.78 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  36.65 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  36.63 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  39.58 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  39.01 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  36.41 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  39.31 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  37.08 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  36.01 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  36.17 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  38.76 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  37.71 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  36.66 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  39.05 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  37.84 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  37.01 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  38.66 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  36.57 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  38.07 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  39.68 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  37.94 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  37.47 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  36.92 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  34.47 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  36.64 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  37.88 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  39.58 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  38.79 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  36.63 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  39.31 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  39.54 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  34.52 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  37.09 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  36.95 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  37.72 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  38.29 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  36.59 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  36.82 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  36.92 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  36.67 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  36.66 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  35.82 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  38.73 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  36.74 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  36.84 
 
 		 415 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  37.35 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  38.07 
 
 		 430 aa  223  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  37.8 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  37.69 
 
 		 415 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  35.56 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  37.35 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  37.01 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  35.77 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  37.94 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  36.67 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  35.7 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  35.52 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  35.59 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  36.9 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  37.38 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  35.34 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  36.21 
 
 		 508 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  38.34 
 
 		 417 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  34.94 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  35.19 
 
 		 415 aa  220  5e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  35.49 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  35.49 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  35.49 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  38.18 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 474 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 429 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  36.26 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>