More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1793 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 440 aa  904    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  49.2 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  48.24 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  43.71 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  42.12 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  41.49 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  40.97 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  45.17 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  41.99 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  41.93 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  34.91 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  38.5 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  37.95 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  35.85 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  35.52 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  37.05 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  38.9 
 
 		 410 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  36.1 
 
 		 417 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  36.78 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  37.5 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  37.71 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  34.66 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  37.5 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  37.28 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  37.35 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  34.38 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  36.39 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  37.02 
 
 		 415 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  38.65 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  37.02 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  36.34 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  38.44 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  36.47 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  36.53 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  36.53 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  36.53 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  34.93 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  35.14 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  35.89 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  35.17 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  35.6 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  34.93 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  36.07 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  36.17 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  37.35 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  36.15 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  35.7 
 
 		 417 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  36.38 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  37.19 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  34.54 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  37.15 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  37.83 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.13 
 
 		 566 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  37.91 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  37.02 
 
 		 417 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  36.84 
 
 		 414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  36.62 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  37.04 
 
 		 413 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  35.86 
 
 		 417 aa  213  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  37.56 
 
 		 415 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  36.06 
 
 		 431 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  37.19 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  37.53 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  36.76 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  33.82 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  35.82 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  37.01 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  36.25 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  37.01 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  36.3 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  36.08 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  37.78 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  34.77 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  38.3 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  37.23 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  36.07 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  36.68 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  37.31 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  37.31 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  33.97 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  36.18 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  37.12 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  36.61 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  36.8 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  35.14 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  36.12 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>