228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1747 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  100 
 
 		 1139 aa  2298    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  42.2 
 
 		 686 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  43.18 
 
 		 701 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  41.88 
 
 		 521 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  39.77 
 
 		 774 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  37.27 
 
 		 1019 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  28.6 
 
 		 449 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 486 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  30.79 
 
 		 445 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  30.48 
 
 		 447 aa  104  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  30.48 
 
 		 447 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  29.84 
 
 		 473 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 680 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 418 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  32.43 
 
 		 442 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  94  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1194 aa  94  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  36.57 
 
 		 578 aa  91.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  29.86 
 
 		 300 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  32.86 
 
 		 292 aa  89.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  28.3 
 
 		 978 aa  88.6  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  29.95 
 
 		 898 aa  85.1  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 632 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 532 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  24.11 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  33.73 
 
 		 452 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  30.86 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  49.44 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  42.39 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  28.82 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  47.19 
 
 		 455 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  47.19 
 
 		 455 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.73 
 
 		 743 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  46.24 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.16 
 
 		 6885 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 2170 aa  76.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  47.19 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_2761  predicted protein  30.33 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.399041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  31.55 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.07 
 
 		 455 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  46.07 
 
 		 455 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  43.48 
 
 		 749 aa  74.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  46.07 
 
 		 455 aa  74.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  44.94 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 305 aa  73.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  43.48 
 
 		 660 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  34.81 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4284  Alkaline phosphatase  32.39 
 
 		 423 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  50 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  43.82 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  43.82 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  26.47 
 
 		 314 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 		 1121 aa  70.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 1209 aa  69.7  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  45.45 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 1137 aa  68.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  28.75 
 
 		 460 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 808 aa  67.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  28.45 
 
 		 549 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.94 
 
 		 729 aa  67.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.22 
 
 		 809 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 435 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  21.62 
 
 		 392 aa  67.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  32.84 
 
 		 468 aa  67.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  24.71 
 
 		 680 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  41.57 
 
 		 456 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  45.57 
 
 		 973 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  39.81 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  41.18 
 
 		 1298 aa  64.7  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  30.77 
 
 		 299 aa  64.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 422 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 593 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  48.78 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.31 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2418  acid phosphatase  27.08 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  33.33 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  43.59 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.36 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  25.35 
 
 		 251 aa  62  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  45.56 
 
 		 438 aa  62  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  41.76 
 
 		 900 aa  62  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  38.2 
 
 		 458 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  30.06 
 
 		 255 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  32.62 
 
 		 489 aa  60.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  29.92 
 
 		 1855 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  40.82 
 
 		 637 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  39.33 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.63 
 
 		 703 aa  58.9  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.53 
 
 		 998 aa  58.9  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.27 
 
 		 1887 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  23.43 
 
 		 465 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.13 
 
 		 429 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  41.57 
 
 		 617 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>